Javascript ถูกปิดใช้งานในเบราว์เซอร์ของคุณเมื่อปิดการใช้งานจาวาสคริปต์ ฟังก์ชันบางอย่างของเว็บไซต์นี้จะไม่ทำงาน
ลงทะเบียนรายละเอียดเฉพาะของคุณและยาเฉพาะที่คุณสนใจ แล้วเราจะจับคู่ข้อมูลที่คุณให้ไว้กับบทความในฐานข้อมูลที่กว้างขวางของเรา และส่งสำเนา PDF ให้คุณทางอีเมลในเวลาที่เหมาะสม
ลักษณะทางคลินิกและโมเลกุลของเชื้อ Klebsiella pneumoniae ที่ดื้อต่อ carbapenem ในโรงพยาบาลตติยภูมิในเซี่ยงไฮ้
Zhou Cong, 1 Wu Qiang, 1 He Leqi, 1 Zhang Hui, 1 Xu Maosuo, 1 Bao Yuyuan, 2 Jin Zhi, 3 Fang Shen 11 ภาควิชาเวชศาสตร์ในห้องปฏิบัติการทางคลินิก, Shanghai Fifth People's Hospital, Fudan University, Shanghai, สาธารณรัฐประชาชน จีน;2 Shanghai Jiaotong Department of Laboratory Medicine, โรงพยาบาลเด็กเซี่ยงไฮ้, เซี่ยงไฮ้, สาธารณรัฐประชาชนจีน;3 Department of Neurology, Shanghai Fifth People's Hospital, Fudan University Corresponding author: Fang Shen, Department of Clinical Laboratory Medicine, Shanghai Fifth People's Hospital, Fudan University, No. 128 Ruili Road, Minhang District, Shanghai, รหัสไปรษณีย์ 200240 ของประเทศจีนโทร +86 18021073261 อีเมล [ป้องกันอีเมล] ความเป็นมา: การหลอมรวมของการดื้อยา carbapenem และภาวะความรุนแรงเกินใน Klebsiella pneumoniae ได้นำไปสู่ความท้าทายด้านสาธารณสุขที่สำคัญในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา มีรายงานมากขึ้นเรื่อยๆ เกี่ยวกับเชื้อ Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) ที่มีความรุนแรงสูงที่ดื้อต่อ carbapenemวัสดุและวิธีการ: การวิเคราะห์ย้อนหลังของการประเมินข้อมูลทางคลินิกของผู้ป่วยที่ติดเชื้อ CR-hvKP ตั้งแต่เดือนมกราคม 2019 ถึงธันวาคม 2020 ในโรงพยาบาลตติยภูมิคำนวณ Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae (hmKP), Klebsiella pneumoniae ที่ดื้อต่อ carbapenem (CR-hmKP) และโรคปอดบวมที่มีความรุนแรงสูงที่ดื้อต่อ carbapenem ที่เก็บได้ภายใน 2 ปี จำนวนเชื้อ Leberella (CR-hvKP) ที่แยกได้การตรวจหา PCR ของยีนต้านทาน ยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง ยีนซีโรไทป์แบบแคปซูล และการพิมพ์ลำดับ multilocus (MLST) ของ CR-hvKP ที่แยกได้ผลลัพธ์: แยกสายพันธุ์ Klebsiella pneumoniae ที่ไม่ซ้ำจำนวน 1081 สายพันธุ์ในระหว่างการศึกษา, รวม Klebsiella pneumoniae 392 สายพันธุ์ (36.3%), CR-hmKP 39 สายพันธุ์ (3.6%) และ CR-hvKP 16 สายพันธุ์ (1.5%)CR-hvKP ประมาณ 31.2% (5/16) จะถูกแยกออกในปี 2019 และประมาณ 68.8% (11/16) ของ CR-hvKP จะถูกแยกออกในปี 2020 ในบรรดาสายพันธุ์ CR-hvKP 16 สายพันธุ์ มี 13 สายพันธุ์ ได้แก่ ST11 และ ซีโรไทป์ K64 1 สายพันธุ์คือ ST11 และ K47 ซีโรไทป์ 1 สายพันธุ์คือ ซีโรไทป์ ST23 และ K1 และ 1 สายพันธุ์คือ ซีโรไทป์ ST86 และ K2ยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง entB, fimH, rmpA2, iutA และ iucA มีอยู่ใน 16 CR-hvKP ที่แยกได้ทั้งหมด ตามด้วย mrkD (n=14), rmpA (n=13), aerobactin (n=2) , AllS ( น=1).16 CR-hvKP ที่แยกได้ทั้งหมดมียีน carbapenemase blaKPC-2 และยีน blaSHV ที่ขยายสเปกตรัม β-lactamaseผลการตรวจลายนิ้วมือ DNA ของ ERIC-PCR พบว่าสายพันธุ์ CR-hvKP 16 สายพันธุ์มีความหลากหลายสูง และแถบของแต่ละสายพันธุ์มีความแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญสรุป: แม้ว่า CR-hvKP จะมีการกระจายเป็นระยะๆ แต่ก็เพิ่มขึ้นทุกปีปี.ดังนั้นควรให้ความสนใจทางคลินิกและควรใช้มาตรการที่จำเป็นเพื่อหลีกเลี่ยงการโคลนและการแพร่กระจายของ superbug CR-hvKPคำสำคัญ: Klebsiella pneumoniae ความต้านทานต่อ carbapenem ความรุนแรงสูง น้ำมูกสูง ระบาดวิทยา
Klebsiella pneumoniae เป็นเชื้อก่อโรคฉวยโอกาสที่สามารถทำให้เกิดการติดเชื้อได้หลากหลาย รวมถึงโรคปอดบวม การติดเชื้อทางเดินปัสสาวะ แบคทีเรีย และเยื่อหุ้มสมองอักเสบ1 ในช่วงสามสิบปีที่ผ่านมาซึ่งแตกต่างจาก Klebsiella pneumoniae (cKP) ซึ่งเป็นโรคเมือกที่เกิดจากเชื้อ Klebsiella pneumoniae (hvKP) ที่มีความรุนแรงสูงได้กลายเป็นเชื้อโรคที่มีความสำคัญทางคลินิกซึ่งสามารถพบได้ในการติดเชื้อที่รุนแรงเช่นฝีในตับทำให้สุขภาพแข็งแรง และบุคคลที่มีภูมิคุ้มกันบกพร่อง2 เป็นที่น่าสังเกตว่าการติดเชื้อเหล่านี้มักจะมาพร้อมกับการติดเชื้อที่แพร่กระจายอย่างทำลายล้าง รวมทั้ง endophthalmitis และเยื่อหุ้มสมองอักเสบ3 การผลิตฟีโนไทป์ของเยื่อเมือกสูง hvKP มักเกิดจากการผลิตโพลีแซ็กคาไรด์แบบแคปซูลที่เพิ่มขึ้นและการมีอยู่ของยีนที่มีความรุนแรงจำเพาะ เช่น rmpA และ rmpA2.4ฟีโนไทป์ของเมือกสูงมักถูกกำหนดโดย "การทดสอบสตริง"อาณานิคม Klebsiella pneumoniae ที่ปลูกในชั่วข้ามคืนบนแผ่นวุ้นเลือดจะขยายเป็นวงเมื่อเกิดเชือกหนืดที่มีความยาว >5 มม. “การทดสอบเชือก” จะเป็นค่าบวก5 การศึกษาเมื่อเร็วๆ นี้พบว่า peg-344, iroB, iucA, rmpA rmpA2 และ rmpA2 เป็นไบโอมาร์คเกอร์ที่สามารถระบุ hvkp ได้อย่างแม่นยำ6 ในการศึกษานี้ Klebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรงสูงถูกกำหนดให้มีฟีโนไทป์ที่มีความหนืดสูง (ผลการทดสอบสตริงที่เป็นบวก) และมีตำแหน่งที่เกี่ยวข้องกับพลาสมิดของเชื้อ Klebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรง (rmpA2, iutA, iucA) ในปี 1980 รายงานกรณีของไต้หวันได้กล่าวถึงชุมชนเป็นครั้งแรก - ฝีในตับที่เกิดจาก hvKP ตามมาด้วยความเสียหายของอวัยวะที่ปลายสุด เช่น เยื่อหุ้มสมองอักเสบและเยื่อบุโพรงมดลูกอักเสบ7,8 hvKP มีการส่งสัญญาณเป็นระยะในหลายประเทศในเอเชีย ยุโรป และอเมริกาแม้ว่าจะมีรายงานกรณีของ hvKP หลายกรณีในยุโรปและอเมริกา แต่ความชุกของ hvKP ส่วนใหญ่เกิดขึ้นในประเทศแถบเอเชีย โดยเฉพาะในจีน9
โดยทั่วไป hvKP มีความไวต่อยาปฏิชีวนะมากกว่า ในขณะที่ Klebsiella pneumonia (CRKP) ที่ดื้อต่อ carbapenem มีพิษน้อยกว่าอย่างไรก็ตาม ด้วยการแพร่กระจายของการดื้อยาและพลาสมิดที่มีความรุนแรง CR-hvKP ได้รับการอธิบายครั้งแรกโดย Zhang et alในปี 2558 และมีรายงานในประเทศเพิ่มมากขึ้น10 เนื่องจาก CR-hvKP สามารถทำให้เกิดการติดเชื้อที่ร้ายแรงและยากต่อการรักษา หากโคลนจากการระบาดใหญ่ปรากฏขึ้น ก็อาจกลายเป็น “จุดสุดยอด” ตัวต่อไปได้จนถึงปัจจุบัน การติดเชื้อส่วนใหญ่ที่เกิดจาก CR-hvKP เกิดขึ้นเป็นระยะๆ และการระบาดเพียงเล็กน้อยนั้นหายาก11,12
ปัจจุบันอัตราการตรวจพบ CR-hvKP ต่ำ และมีการศึกษาที่เกี่ยวข้องเพียงเล็กน้อยระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ CR-hvKP มีความแตกต่างกันในภูมิภาคต่างๆ ดังนั้นจึงจำเป็นต้องศึกษาการกระจายทางคลินิกและลักษณะทางระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ CR-hvKP ในภูมิภาคนี้การศึกษานี้วิเคราะห์ยีนต้านทาน ยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง และ MLST ของ CR-hvKP อย่างละเอียดเราพยายามตรวจสอบความชุกและระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ CR-hvKP ในโรงพยาบาลตติยภูมิในเซี่ยงไฮ้ ทางตะวันออกของจีนการศึกษานี้มีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการทำความเข้าใจระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ CR-hvKP ในเซี่ยงไฮ้
Klebsiella pneumoniae ที่ไม่ซ้ำซากที่แยกจากโรงพยาบาล Shanghai Fifth People's Hospital ในเครือของมหาวิทยาลัย Fudan ตั้งแต่เดือนมกราคม 2019 ถึงธันวาคม 2020 ถูกรวบรวมย้อนหลัง และคำนวณเปอร์เซ็นต์ของ hmKP, CRKP, CR-hmkp และ CR-hvKPไอโซเลททั้งหมดถูกระบุโดยเครื่องวิเคราะห์จุลินทรีย์อัตโนมัติขนาดกะทัดรัด VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, France)Maldi-Tof mass spectrometry (Bruker Daltonics, Billerica, MA, USA) ถูกใช้เพื่อตรวจสอบการระบุสายพันธุ์แบคทีเรียอีกครั้งฟีโนไทป์ของเมือกสูงถูกกำหนดโดย "การทดสอบสตริง"เมื่อ imipenem หรือ meropenem ดื้อต่อ carbapenem จะถูกกำหนดโดยการทดสอบความไวต่อยาKlebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรงสูงถูกกำหนดให้มีฟีโนไทป์ของเมือกสูง (ผลการทดสอบสตริงที่เป็นบวก) และมีตำแหน่งที่เกี่ยวข้องกับพลาสมิดที่มีความรุนแรงของ Klebsiella pneumoniae (rmpA2, iutA, iucA)6
อาณานิคม Klebsiella pneumoniae หนึ่งกลุ่มถูกเพาะเลี้ยงบนจานวุ้นเลือดแกะ 5%หลังจากฟักไข่ค้างคืนที่อุณหภูมิ 37°C ค่อยๆ ดึงโคโลนีขึ้นด้วยห่วงเพาะเชื้อและทำซ้ำ 3 ครั้งหากเส้นหนืดเกิดขึ้นสามครั้งและมีความยาวมากกว่า 5 มม. ถือว่า "การทดสอบเส้น" เป็นบวก และความเครียดมีฟีโนไทป์ของเมือกสูง
ในเครื่องวิเคราะห์จุลินทรีย์อัตโนมัติขนาดกะทัดรัด VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, France) ตรวจพบความไวต่อยาต้านจุลชีพต่อยาปฏิชีวนะที่ใช้กันทั่วไปหลายชนิดโดยน้ำซุปแบบไมโครเจือจางผลลัพธ์จะถูกตีความตามเอกสารแนวทางที่พัฒนาโดยสถาบันมาตรฐานทางคลินิกและห้องปฏิบัติการ (CLSI, 2019)E. coli ATCC 25922 และ Klebsiella pneumoniae ATCC 700603 ถูกใช้เป็นตัวควบคุมสำหรับการทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพ
จีโนม DNA ของ Klebsiella pneumoniae ที่แยกได้ทั้งหมดถูกสกัดโดย TIANamp Bacteria Genomic DNA Kit (Tiangen Biotech Co. Ltd., Beijing, China)ยีน β-lactamase แบบขยายสเปกตรัม (blaCTX-M, blaSHV และ blaTEM), ยีน carbapenemase (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaIMP และ blaOXA-48) และยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรงที่เป็นตัวแทน 9 ยีน ซึ่งรวมถึง pLVPK Plasmid-like loci (allS, fimH , mrkD, entB, iutA, rmpA, rmpA2, iucA และ aerobactin) ถูกขยายโดย PCR ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้13,14 ยีนเฉพาะซีโรไทป์ของแคปซูล (K1, K2, K5, K20, K54 และ K57) ถูกขยายโดย PCR ตามที่อธิบายข้างต้น14 หากเป็นลบ ให้ขยายและจัดลำดับ wzi locus เพื่อกำหนดยีนเฉพาะของซีโรไทป์ของ capsular15 ไพรเมอร์ที่ใช้ในการศึกษานี้แสดงไว้ในตาราง S1ผลิตภัณฑ์ PCR เชิงบวกได้รับการจัดลำดับโดยแพลตฟอร์มการจัดลำดับ NextSeq 500 (อิลลูมินา ซานดิเอโก แคลิฟอร์เนีย สหรัฐอเมริกา)เปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์โดยเรียกใช้ BLAST บนเว็บไซต์ NCBI (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)
การพิมพ์ลำดับแบบหลายไซต์ (MLST) ถูกดำเนินการตามที่อธิบายไว้ในเว็บไซต์ MLST ของสถาบันปาสเตอร์ (https://bigsdb.pasteur.fr/klebsiella/klebsiella.html)ยีนดูแลทำความสะอาดทั้งเจ็ด gapA, infB, mdh, pgi, phoE, rpoB และ tonB ถูกขยายโดย PCR และจัดลำดับประเภทลำดับ (ST) ถูกกำหนดโดยการเปรียบเทียบผลการจัดลำดับกับฐานข้อมูล MLST
วิเคราะห์ความคล้ายคลึงของ Klebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniae genomic DNA ถูกสกัดเป็นแม่แบบ และไพรเมอร์ ERIC ถูกแสดงไว้ในตาราง S1PCR ขยายจีโนม DNA และสร้างลายนิ้วมือของ DNA จีโนมผลิตภัณฑ์ PCR จำนวน 16 รายการ ตรวจพบโดย agarose gel electrophoresis 2%ผลการตรวจลายนิ้วมือของ DNA ถูกระบุโดยใช้การจดจำแถบซอฟต์แวร์ QuantityOne และการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมดำเนินการโดยใช้วิธี unweighted paired group method (UPGMA) ของค่าเฉลี่ยเลขคณิตไอโซเลทที่มีความคล้ายคลึงกัน> 75% ถือเป็นจีโนไทป์เดียวกัน และที่มีความคล้ายคลึงกัน <75% ถือเป็นจีโนไทป์ที่แตกต่างกัน
ใช้แพ็คเกจซอฟต์แวร์ทางสถิติ SPSS สำหรับ Windows 22.0 เพื่อวิเคราะห์ข้อมูลข้อมูลถูกอธิบายว่าเป็นค่าเฉลี่ย±ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน (SD)ตัวแปรตามหมวดหมู่ได้รับการประเมินโดยการทดสอบไคสแควร์หรือการทดสอบที่แน่นอนของฟิชเชอร์การทดสอบทางสถิติทั้งหมดเป็นแบบ 2 ด้าน และค่า P ที่ <0.05 ถือว่ามีนัยสำคัญทางสถิติ
โรงพยาบาล Shanghai Fifth People ในเครือของมหาวิทยาลัย Fudan เก็บเชื้อ Klebsiella pneumoniae จำนวน 1081 ตัวตั้งแต่วันที่ 1 มกราคม 2019 ถึงวันที่ 31 ธันวาคม 2020 และไม่รวมผู้ป่วยที่แยกจากกันซ้ำซ้อนในหมู่พวกเขา 392 สายพันธุ์ (36.3%) คือ hmKP, 341 สายพันธุ์ (31.5%) คือ CRKP, 39 สายพันธุ์ (3.6%) คือ CR-hmKP และ 16 สายพันธุ์ (1.5%) คือ CR-hvKPเป็นที่น่าสังเกตว่า 33.3% (13/39) ของ CR-hmKP และ 31.2% (5/16) ของ CR-hvKP มาจาก 2019, 66.7% (26/39) ของ CR-hmKP และ 68.8% (11/16) ) CR-hvKP ถูกแยกออกจากปี 2020 จากเสมหะ (17 สายพันธุ์) ปัสสาวะ (12 สายพันธุ์) ของเหลวระบายน้ำ (4 สายพันธุ์) เลือด (2 สายพันธุ์) หนอง (2 สายพันธุ์) น้ำดี (1 การแยก) และเยื่อหุ้มปอด (1 การแยก) ตามลำดับCR-hvKP สิบหกชนิดถูกกู้คืนจากเสมหะ (9 ไอโซเลท), ปัสสาวะ (5 ไอโซเลท), เลือด (1 ไอโซเลท) และเยื่อหุ้มปอด (1 ไอโซเลท)
ผ่านการระบุสายพันธุ์ การทดสอบความไวของยา การทดสอบสตริง และการตรวจจับยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง คัดกรองสายพันธุ์ CR-hvKP 16 สายพันธุ์ลักษณะทางคลินิกของผู้ป่วย 16 รายที่ติดเชื้อ CR-hvKP isolates สรุปได้ในตารางที่ 1 13 ใน 16 ราย (81.3%) เป็นผู้ชาย และผู้ป่วยทุกรายมีอายุมากกว่า 62 ปี (อายุเฉลี่ย: 83.1±10.5 ปี)พวกเขามาจาก 8 หอผู้ป่วย และมากกว่าครึ่งมาจากห้อง ICU ส่วนกลาง (9 ราย)โรคพื้นฐาน ได้แก่ โรคหลอดเลือดสมอง (75%, 12/16), ความดันโลหิตสูง (50%, 8/16), โรคปอดอุดกั้นเรื้อรัง (50%, 8/16) เป็นต้น การผ่าตัดแบบรุกรานรวมถึงการช่วยหายใจ (62.5%, 10/ 16), สายสวนปัสสาวะ (37.5%, 6/16), ท่อกระเพาะอาหาร (18.8%, 3/16), การผ่าตัด (12.5%, 2/16) และสายสวนทางหลอดเลือดดำ (6.3%, 1/16)ผู้ป่วย 9 รายจากทั้งหมด 16 รายเสียชีวิต และผู้ป่วย 7 รายมีอาการดีขึ้นและออกจากโรงพยาบาลแล้ว
แยก CR-hmKP 39 ตัวออกเป็นสองกลุ่มตามความยาวของสายเหนียวในหมู่พวกเขานั้น CR-hmKP 20 ตัวที่มีความยาวสายหนืด ≤ 25 มม. ถูกแบ่งออกเป็นกลุ่มเดียว และ CR-hmKP 19 ตัวที่มีความยาวสายหนืด> 25 มม. ถูกแบ่งออกเป็นกลุ่มอื่นวิธี PCR ตรวจจับอัตราบวกของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง rmpA, rmpA2, iutA และ iucAอัตราบวกของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง CR-hmKP ในทั้งสองกลุ่มแสดงไว้ในตารางที่ 2 ไม่มีความแตกต่างทางสถิติในอัตราบวกของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง CR-hmKP ระหว่างทั้งสองกลุ่ม
ตารางที่ 3 แสดงโปรไฟล์การดื้อยาต้านจุลชีพโดยละเอียดของยา 16 ชนิด16 CR-hvKP ที่แยกได้แสดงการดื้อต่อยาหลายชนิดไอโซเลททั้งหมดได้รับการรักษาด้วยแอมพิซิลลิน, แอมพิซิลลิน/ซัลแบคแทม, เซโฟเปราโซน/ซัลแบคแทม, พิเพอราซิลลิน/ทาโซแบคแทม, เซฟาโซลิน, เซฟาโรซิม, เซฟทาซิดิม, เซฟเทรียโซน, เซเฟปิเม, เซโฟซิติน, อิมิพีเนม และเมโรเพนเนมTrimethoprim-sulfamethoxazole มีอัตราการดื้อยาต่ำสุด (43.8%) รองลงมาคือ amikacin (62.5%), gentamicin (68.8%) และ ciprofloxacin (87.5%)
การกระจายของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง ยีนดื้อยาต้านจุลชีพ ยีนแคปซูลซีโรไทป์ และ MLST ของ 16 CR-hvKP ที่แยกได้แสดงไว้ในรูปที่ 1 ผลลัพธ์ของ agarose gel electrophoresis ของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง ยีนต้านทานการต้านจุลชีพ และยีนซีโรไทป์ของแคปซูล แสดงในรูปที่ 1 รูปที่ 2 การวิเคราะห์ MLST แสดงทั้งหมด 3 STs ST11 เป็น ST ที่โดดเด่นที่สุด (87.5%, 14/16) ตามด้วย ST23 (6.25%, 1/16) และ ST86 (6.25%, 1 /16).จากผลลัพธ์ของการพิมพ์ wzi พบว่ามีการระบุ capsular serotypes 4 ชนิด (รูปที่ 1)ในบรรดา 16 สายพันธุ์ที่ดื้อต่อ carbapenem hvKP นั้น K64 เป็นซีโรไทป์ที่พบได้บ่อยที่สุด (n=13) ตามด้วย K1 (n=1), K2 (n=1) และ K47 (n=1)นอกจากนี้ แคปซูลซีโรไทป์ K1 สายพันธุ์คือ ST23, แคปซูลซีโรไทป์ K2 สายพันธุ์คือ ST86 และอีก 13 สายพันธุ์ที่เหลือของ K64 และ 1 สายพันธุ์ของ K47 เป็น ST11 ทั้งหมดอัตราบวกของยีนความรุนแรง 9 ยีนใน 16 CR-hvKP ที่แยกได้แสดงไว้ในรูปที่ 1 ยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง entB, fimH, rmpA2, iutA และ iucA มีอยู่ใน 16 CR-hvKP สายพันธุ์ ตามด้วย mrkD (n = 14), rmpA (n = 13), แอโรแบคทีเรีย (n = 2) , AllS (n=1)16 CR-hvKP ที่แยกได้ทั้งหมดมียีน carbapenemase blaKPC-2 และยีน blaSHV ที่ขยายสเปกตรัม β-lactamase16 CR-hvKP ที่แยกได้ไม่มียีน carbapenem blaNDM, blaVIM, blaIMP, blaOXA-48 และยีน blaTEM กลุ่ม blaCTX-M-2 และกลุ่ม blaCTX-M-8 ที่มีสเปกตรัมขยายสเปกตรัมในบรรดาสายพันธุ์ CR-hvKP 16 สายพันธุ์ มี 5 สายพันธุ์ที่มีกลุ่ม Extended-Spectrum β-lactamase blaCTX-M-1 และ 6 สายพันธุ์มีกลุ่ม blaCTX-M-9 ยีน blaCTX-M-9 ที่ขยายสเปกตรัม
รูปที่ 1 ยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง ยีนดื้อยาต้านจุลชีพ ยีนซีโรไทป์ของแคปซูล และ MLST ของ 16 CR-hvKP ไอโซเลท
รูปที่ 2 อะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรง ยีนต้านทานการต้านจุลชีพ และยีนซีโรไทป์แบบแคปซูล
หมายเหตุ: M, เครื่องหมาย DNA;1, blaKPC (893bp);2, entB (400bp);3, rmpA2 (609bp);4, rmpA (429bp);5, ไอยูซี (239bp);6, iutA (880bp);7 , แอโรแบคทีเรีย (556bp);8, K1 (1283bp);9, K2 (641bp);10, S ทั้งหมด (508bp);11, mrkD (340bp);12, fimH (609bp).
ERIC-PCR ใช้ในการวิเคราะห์ความคล้ายคลึงกันของ 16 CR-hvKP ที่แยกได้หลังจากการขยาย PCR และอะกาโรสเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสมีชิ้นส่วนดีเอ็นเอ 3-9 ชิ้นผลการตรวจลายนิ้วมือพบว่า 16 CR-hvKP isolates มีความหลากหลายสูง และมีความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างไอโซเลท (รูปที่ 3)
ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา มีรายงานเกี่ยวกับเชื้อ CR-hvKP ที่แยกออกมามากขึ้นเรื่อยๆการปรากฏตัวของ CR-hvKP ที่แยกได้ก่อให้เกิดภัยคุกคามที่สำคัญต่อสุขภาพของประชาชนเพราะอาจทำให้เกิดการติดเชื้อร้ายแรงและยากต่อการรักษาในคนที่มีสุขภาพดีในการศึกษานี้ ได้ทำการศึกษาความชุกและลักษณะทางระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ CR-hvKP ในโรงพยาบาลระดับตติยภูมิในเซี่ยงไฮ้ระหว่างปี 2019 ถึง 2020 เพื่อประเมินว่ามีความเสี่ยงของการระบาดของ CR-hvKP และแนวโน้มการพัฒนาในพื้นที่นี้หรือไม่ในเวลาเดียวกัน การศึกษานี้สามารถให้การประเมินที่ครอบคลุมมากขึ้นของการติดเชื้อทางคลินิก ซึ่งมีความสำคัญอย่างมากในการป้องกันการแพร่กระจายของไอโซเลตดังกล่าวต่อไป
การศึกษานี้วิเคราะห์การกระจายทางคลินิกและแนวโน้มของ CR-hvKP ย้อนหลังตั้งแต่ปี 2019 ถึง 2020 จากปี 2019 ถึง 2020 การแยก CR-hvKP มีแนวโน้มเพิ่มขึ้นประมาณ 31.2% (5/16) ของ CR-hvKP ถูกแยกออกในปี 2019 และ 68.8% (11/16) ของ CR-hvKP ถูกแยกออกในปี 2020 ซึ่งสอดคล้องกับแนวโน้มที่สูงขึ้นของ CR-hvKP ที่รายงานในวรรณกรรมตั้งแต่ Zhang et al.อธิบาย CR-hvKP ครั้งแรกในปี 2015 มีรายงานวรรณคดี CR-hvKP เพิ่มขึ้นเรื่อยๆ 10 ฉบับ 17-20 ส่วนใหญ่อยู่ในภูมิภาคเอเชียแปซิฟิก โดยเฉพาะอย่างยิ่งในประเทศจีนCR-hvKP เป็นซุปเปอร์แบคทีเรียที่มีพิษร้ายแรงและดื้อยาหลายชนิดเป็นอันตรายต่อสุขภาพของประชาชนและมีอัตราการเสียชีวิตสูงดังนั้นควรให้ความสนใจและดำเนินมาตรการเพื่อป้องกันการแพร่กระจาย
การวิเคราะห์การดื้อยาปฏิชีวนะของเชื้อ CR-hvKP 16 ตัว พบว่ามีอัตราการดื้อยาปฏิชีวนะสูงไอโซเลททั้งหมดได้รับการรักษาด้วยแอมพิซิลลิน, แอมพิซิลลิน/ซัลแบคแทม, เซโฟเปราโซน/ซัลแบคแทม, พิเพอราซิลลิน/ทาโซแบคแทม, เซฟาโซลิน, เซฟาโรซิม, เซฟทาซิดิม, เซฟเทรียโซน, เซเฟปิเม, เซโฟซิติน, อิมิพีเนม และเมโรเพนเนมTrimethoprim-sulfamethoxazole มีอัตราการดื้อยาต่ำสุด (43.8%) รองลงมาคือ amikacin (62.5%), gentamicin (68.8%) และ ciprofloxacin (87.5%)อัตราความต้านทานของ CR-hmkp ที่ศึกษาโดย Lingling Zhan และคนอื่นๆ มีความคล้ายคลึงกับการศึกษานี้ [12]ผู้ป่วยที่ติดเชื้อ CR-hvKP มีโรคพื้นฐานหลายอย่าง ภูมิคุ้มกันต่ำ และความสามารถในการฆ่าเชื้ออิสระที่อ่อนแอดังนั้นการรักษาตามผลการทดสอบความไวต่อยาต้านจุลชีพอย่างทันท่วงทีจึงมีความสำคัญมากหากจำเป็น จะสามารถพบและรักษาบริเวณที่ติดเชื้อได้โดยการระบายน้ำ การขจัดคราบออก และวิธีการอื่นๆ
แยก CR-hmKP 39 ตัวออกเป็นสองกลุ่มตามความยาวของสายเหนียวในหมู่พวกเขานั้น CR-hmKP 20 ตัวที่มีความยาวสายหนืด ≤ 25 มม. ถูกแบ่งออกเป็นกลุ่มเดียว และ CR-hmKP 19 ตัวที่มีความยาวสายหนืด> 25 มม. ถูกแบ่งออกเป็นกลุ่มอื่นเมื่อเปรียบเทียบอัตราบวกของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรงของ CR-hmKP ระหว่างทั้งสองกลุ่ม ไม่มีความแตกต่างที่มีนัยสำคัญทางสถิติในอัตราบวกของยีนที่มีความรุนแรงระหว่างทั้งสองกลุ่มการวิจัยโดย Lin Ze et al.พบว่าอัตราบวกของยีนความรุนแรงของ Klebsiella pneumoniae สูงกว่ายีน Klebsiella pneumoniae แบบคลาสสิกอย่างมีนัยสำคัญ21 อย่างไรก็ตาม อัตราบวกของยีนความรุนแรงมีความสัมพันธ์เชิงบวกกับความยาวของสายโซ่เหนียวหรือไม่นั้นยังคงไม่ชัดเจนการศึกษาอื่น ๆ แสดงให้เห็นว่า Klebsiella pneumoniae แบบคลาสสิกอาจเป็นโรค Klebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรงสูงโดยมีอัตรายีนที่มีความรุนแรงในเชิงบวกสูงขึ้น22 การศึกษานี้พบว่าอัตราบวกของยีนความรุนแรงของ CR-hmKP ไม่มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับความยาวของเมือกสตริง (หรือไม่เพิ่มขึ้นตามความยาวของสตริงที่ปักหมุด)
ลายนิ้วมือของ ERIC PCR ในการศึกษาครั้งนี้เป็นแบบพหุมอร์ฟิค และไม่มีการตรวจทางคลินิกระหว่างผู้ป่วย ดังนั้นผู้ป่วย 16 รายที่ติดเชื้อ CR-hvKP จึงเป็นเคสประปรายในอดีต การติดเชื้อส่วนใหญ่ที่เกิดจาก CR-hvKP ได้รับรายงานเป็นกรณีที่แยกได้หรือเป็นระยะๆ 23,24 และการระบาดของ CR-hvKP ขนาดเล็กนั้นหาได้ยากในวรรณคดี11,25 ST11 เป็น ST11 ที่พบมากที่สุดใน CRKP และ CR-hvKP ที่แยกได้ในประเทศจีน26,27 แม้ว่า ST11 CR-hvKP คิดเป็น 87.5% (14/16) ของ 16 CR-hvKP ที่แยกได้ในการศึกษานี้ แต่ก็ไม่สามารถสันนิษฐานได้ว่า 14 ST11 CR-hvKP สายพันธุ์มาจากโคลนเดียวกัน ดังนั้น ERIC PCR ลายนิ้วมือ ต้องระบุ.การวิเคราะห์ความคล้ายคลึงกัน
ในการศึกษานี้ ผู้ป่วยทั้ง 16 รายที่ติดเชื้อ CR-hvKP ได้รับการผ่าตัดรุกรานตามรายงาน การระบาดร้ายแรงของโรคปอดบวมที่เกี่ยวข้องกับเครื่องช่วยหายใจที่เกิดจาก CR-hvKP11 บ่งชี้ว่าขั้นตอนการบุกรุกอาจเพิ่มความเสี่ยงของการติดเชื้อ CR-hvKPในเวลาเดียวกัน ผู้ป่วย 16 รายที่ติดเชื้อ CR-hvKP มีโรคพื้นเดิม ซึ่งโรคหลอดเลือดหัวใจเป็นโรคที่พบได้บ่อยที่สุดการศึกษาก่อนหน้านี้แสดงให้เห็นว่าโรคหลอดเลือดสมองเป็นปัจจัยเสี่ยงที่เป็นอิสระอย่างมีนัยสำคัญสำหรับการติดเชื้อ CR-hvKP28 สาเหตุของปรากฏการณ์นี้อาจเป็นเพราะภูมิคุ้มกันอ่อนแอของผู้ป่วยโรคหลอดเลือดสมอง แบคทีเรียก่อโรคไม่สามารถแยกออกโดยอิสระได้ และอาศัยผลการฆ่าเชื้อแบคทีเรียเท่านั้นยาปฏิชีวนะจะนำไปสู่การดื้อยาหลายขนานและความรุนแรงสูงในระยะยาวในผู้ป่วย 16 ราย เสียชีวิต 9 ราย และมีอัตราการเสียชีวิต 56.3% (9/16)อัตราการเสียชีวิตสูงกว่า 10,12 ในการศึกษาก่อนหน้านี้และต่ำกว่า 11,21 รายงานในการศึกษาก่อนหน้านี้อายุเฉลี่ยของผู้ป่วย 16 คนเท่ากับ 83.1±10.5 ปี ซึ่งบ่งชี้ว่าผู้สูงอายุมีความเสี่ยงต่อ CR-hvKP มากกว่าการศึกษาก่อนหน้านี้แสดงให้เห็นว่าคนหนุ่มสาวมีความอ่อนไหวต่อการติดเชื้อมากกว่าความรุนแรงของเชื้อ Klebsiella pneumoniae29 อย่างไรก็ตาม การศึกษาอื่น ๆ ได้แสดงให้เห็นว่าผู้สูงอายุมีความเสี่ยงต่อการติดเชื้อ Klebsiella pneumoniae24,28 ที่มีความรุนแรงสูงการศึกษานี้สอดคล้องกับสิ่งนี้
ในบรรดาสายพันธุ์ CR-hvKP 16 สายพันธุ์ ยกเว้น ST23 CR-hvKP หนึ่งสายและ ST86 CR-hvKP หนึ่งสาย ส่วนอีก 14 สายพันธุ์คือ ST11 CR-hvKP ทั้งหมดซีโรไทป์ของแคปซูลที่สอดคล้องกับ ST23 CR-hvKP คือ K1 และซีโรไทป์ของแคปซูลที่สอดคล้องกันของ ST86 CR-HVKP คือ K2 ซึ่งคล้ายกับการศึกษาก่อนหน้านี้30-32 ผู้ป่วยที่ติดเชื้อ ST23 (K1) CR-hvKP หรือ ST86 (K2) CR-hvKP เสียชีวิต และอัตราการเสียชีวิต (100%) สูงกว่าผู้ป่วยที่ติดเชื้อ ST11 CR-hvKP (50%) อย่างมีนัยสำคัญดังแสดงในรูปที่ 1 อัตราบวกของสายพันธุ์ ST23 (K1) หรือ ST86 (K2) ของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรงนั้นสูงกว่าสายพันธุ์ ST11 (K64)การตายอาจเกี่ยวข้องกับอัตราบวกของยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรงในการศึกษานี้ CR-hvKP 16 สายพันธุ์ทั้งหมดมียีน carbapenemase blaKPC-2 และยีนβ-lactamase blaSHV แบบขยายสเปกตรัมblaKPC-2 เป็นยีน carbapenemase ที่พบมากที่สุดใน CR-hvKP ในประเทศจีน33 ในการศึกษา Zhao et al. 25blaSHV เป็นยีน β-lactamase แบบขยายสเปกตรัมที่มีอัตราบวกสูงสุดยีนความรุนแรง entB, fimH, rmpA2, iutA และ iucA มีอยู่ใน CR-hvKP ทั้งหมด 16 สายพันธุ์ ตามด้วย mrkD (n=14), rmpA (n=13), anaerobicin (n=2), allS (n = 1) ซึ่งคล้ายกับการศึกษาก่อนหน้านี้34 การศึกษาบางชิ้นแสดงให้เห็นว่า rmpA และ rmpA2 (โมดูเลเตอร์ของยีนฟีโนไทป์ของเมือก) สามารถส่งเสริมการหลั่งของพอลิแซ็กคาไรด์แบบแคปซูล นำไปสู่ฟีโนไทป์ของไฮเปอร์mucoid และเพิ่มความรุนแรง35 Aerobacterins ถูกเข้ารหัสโดยยีน iucABCD และตัวรับที่คล้ายคลึงกันของพวกมันถูกเข้ารหัสโดยยีน iutA ดังนั้นจึงมีระดับความรุนแรงที่สูงขึ้นในการทดสอบการติดเชื้อ G. mellonellaallS เป็นเครื่องหมายของ K1-ST23 ไม่ใช่ใน pLVPK pLVPK เป็นพลาสมิดที่มีความรุนแรงจาก K2 super virulence typeallS เป็นตัวกระตุ้นการถอดรหัสประเภท HTHเป็นที่ทราบกันว่ายีนที่มีความรุนแรงเหล่านี้มีส่วนทำให้เกิดความรุนแรงและมีหน้าที่รับผิดชอบในการล่าอาณานิคม การบุกรุก และการเกิดโรค36
การศึกษานี้อธิบายความชุกและระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ CR-hvKP ในเซี่ยงไฮ้ ประเทศจีนแม้ว่าการติดเชื้อที่เกิดจาก CR-hvKP จะเป็นระยะๆ แต่ก็เพิ่มขึ้นทุกปีผลลัพธ์สนับสนุนการวิจัยก่อนหน้านี้และแสดงให้เห็นว่า ST11 CR-hvKP เป็น CR-hvKP ที่ได้รับความนิยมมากที่สุดในประเทศจีนST23 และ ST86 CR-hvKP มีความรุนแรงสูงกว่า ST11 CR-hvKP แม้ว่าทั้งคู่จะเป็น Klebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรงสูงเมื่อเปอร์เซ็นต์ของเชื้อ Klebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรงสูงเพิ่มขึ้น อัตราความต้านทานของ Klebsiella pneumoniae อาจลดลง ซึ่งจะนำไปสู่การมองโลกในแง่ดีแบบตาบอดในการปฏิบัติทางคลินิกดังนั้นจึงจำเป็นต้องศึกษาความเป็นพิษและการดื้อยาของเชื้อ Klebsiella pneumoniae
การศึกษานี้ได้รับการอนุมัติโดยคณะกรรมการจริยธรรมทางการแพทย์ของโรงพยาบาล Shanghai Fifth People's Hospital (ฉบับที่ 104, 2020)ตัวอย่างทางคลินิกเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการทางห้องปฏิบัติการของโรงพยาบาลตามปกติ
ขอขอบคุณเจ้าหน้าที่ห้องปฏิบัติการกลางของโรงพยาบาล Shanghai Fifth People's ทุกคนที่ให้คำแนะนำด้านเทคนิคสำหรับการศึกษานี้
งานนี้ได้รับการสนับสนุนโดย Natural Science Foundation of Minhang District, Shanghai (หมายเลขอนุมัติ: 2020MHZ039)
1. Navon-Venezia S, Kondratyeva K, Carattoli A. Klebsiella pneumoniae: แหล่งหลักระดับโลกและรถรับส่งสำหรับการดื้อยาปฏิชีวนะFEMS จุลชีววิทยาฉบับปรับปรุง 2017;41(3): 252–275.ดอย:10.1093/femsre/fux013
2. Prokesch BC, TeKippe M, Kim J เป็นต้น โรคกระดูกพรุนปฐมภูมิที่เกิดจากความเป็นพิษสูงLancet ติดเชื้อ Dis.2016;16(9):e190–e195.ดอย:10.1016/S1473-3099(16)30021-4
3. Shon AS, Bajwa RPS, รัสเซีย TAความรุนแรงสูง (เมือกซุปเปอร์)Klebsiella pneumoniae ความรุนแรง2014;4(2): 107–118.ดอย:10.4161/viru.22718
4. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: บุกต่อไปด้วยการป้องกันที่แข็งแกร่งMicrobiol Mol จิตเวช Rev. 2016;80(3):629–661.ดอย:10.1128/MMBR.00078-15
5. Fang C, Chuang Y, Shun C และอื่น ๆยีนความรุนแรงใหม่ของ Klebsiella pneumoniae ทำให้เกิดฝีในตับขั้นต้นและภาวะแทรกซ้อนระยะแพร่กระจายของภาวะติดเชื้อเจ เอ็กซ์พี เมด2004;199(5):697–705.ดอย:10.1084/jem.20030857
6. Russo TA, Olson R, Fang CT เป็นต้น การระบุ J Clin Microbiol ซึ่งเป็น biomarker ที่ใช้ในการแยกแยะ Klebsiella pneumoniae ที่มีความรุนแรงสูงจาก Klebsiella pneumoniae แบบคลาสสิก2018;56(9):e00776.
7. YCL เฉิง DL หลิน CLKlebsiella pneumoniae ฝีในตับที่เกี่ยวข้องกับ endophthalmitis ติดเชื้อแพทย์ฝึกอาร์ค.2529;146(10):1913-1916.ดอย:10.1001/archinte.1986.00360220057011
8. Chiu C, Lin D, Liaw Y. endophthalmitis ติดเชื้อระยะแพร่กระจายในฝีในตับเป็นหนองเจคลินิกระบบทางเดินอาหาร.1988;10(5):524–527.ดอย:10.1097/00004836-198810000-00009
9. Guo Yan, Wang Shun, Zhan Li เป็นต้น ลักษณะทางจุลชีววิทยาและทางคลินิกของ Klebsiella pneumoniae ที่มีเมือกสูงซึ่งสัมพันธ์กับการติดเชื้อที่แพร่กระจายในประเทศจีนเซลล์พรีเซลล์ติดเชื้อจุลินทรีย์2017;7.
10. Zhang Yi, Zeng Jie, Liu Wei เป็นต้น การเกิดขึ้นของสายพันธุ์ Klebsiella pneumoniae ที่ดื้อต่อ carbapenem ที่มีความรุนแรงสูงในการติดเชื้อทางคลินิกในประเทศจีน[J]การติดเชื้อเจ2558;71(5): 553–560.ดอย:10.1016/j.jinf.2015.07.010
11. Gu De, Dong Nan, Zheng Zhong เป็นต้น การระบาดของโรคปอดบวม Klebsiella ที่มีความรุนแรงสูงที่ดื้อต่อ carbapenem ST11 ในโรงพยาบาลจีน: การศึกษาทางระบาดวิทยาระดับโมเลกุลLancet ติดเชื้อ Dis.2018;18(1):37–46.ดอย:10.1016/S1473-3099(17)30489-9
12. Zhan Li, Wang S, Guo Yan และอื่น ๆการระบาดของสายพันธุ์ที่ดื้อต่อ carbapenem ST11 hypermucoid Klebsiella pneumoniae ในโรงพยาบาลระดับตติยภูมิในประเทศจีนเซลล์พรีเซลล์ติดเชื้อจุลินทรีย์2017;7.
13. FRE, Messai Y, Alouache S เป็นต้น Klebsiella pneumoniae สเปกตรัมความรุนแรงและแบบจำลองความไวของยาที่แยกได้จากตัวอย่างทางคลินิกต่างๆ[J]พยาธิสรีรวิทยา.2013;61(5):209-216.ดอย:10.1016/j.patbio.2012.100.004
14. Turton JF, Perry C, Elgohari S, ฯลฯ. การกำหนดลักษณะเฉพาะ PCR และการพิมพ์ของ Klebsiella pneumoniae โดยใช้ความจำเพาะแบบ capsular จำนวนตัวแปรของการทำซ้ำตีคู่และเป้าหมายของยีนความรุนแรง[J]เจ เมด จุลชีววิทยา.2010;59 (บทที่ 5): 541–547ดอย:10.1099/jmm.0.015198-0
15. Brisse S, Passet V, Haugaard AB เป็นต้น การจัดลำดับยีน Wzi ซึ่งเป็นวิธีที่รวดเร็วในการกำหนดประเภทของแคปซูล Klebsiella[J]เจ จุลชีววิทยาคลินิก.2013;51(12):4073-4078.ดอย:10.1128/JCM.01924-13
16. Ranjbar R, Tabatabaee A, Behzadi P เป็นต้น สายพันธุ์ E. coli ที่แยกได้จากตัวอย่างอุจจาระของสัตว์ต่างๆ ยีน enterobacteria repetitive gene types consensus polymerase chain reaction (ERIC-PCR) genotyping[J]อิหร่าน เจ. ปทุม.2017;12(1): 25–34.ดอย:10.30699/ijp.2017.21506
เวลาโพสต์: ก.ค.-15-2021